มหาวิทยาลัยมหิดล ได้รับการจัดอันดับเป็นที่ 1 ของประเทศไทย อันดับที่ 2 ของเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ อันดับที่ 36 ของเอเชีย และอันดับที่ 273 ของโลก จากผลการจัดอันดับ Webometrics Ranking of World Universities ซึ่งมีการประกาศผลเมื่อปลายเดือนกรกฎาคม 2557 ที่ผ่านมา ทาง
การจัดอันดับ "Webometrics Ranking of World Universities" จัดทำโดย Cybermetrics Lab หรือ Internet Lab ซึ่งเป็นกลุ่มวิจัยของสภาวิจัยแห่งชาติ ประเทศสเปน เริ่มดำเนินการตั้งแต่ ปี ค.ศ. 2004 จะการประกาศผลการจัดอันดับเว็บไซต์ 2 ครั้งต่อปี คือช่วงเดือนมกราคมและช่วงเดือนกรกฎาคม ของทุกปี ผ่านทางเว็บไซต์ www.webometrics.info ทั้งนี้ การจัดอันดับเว็บไซต์นั้นเพื่อวัดผลงานทางวิชาการที่มีการเผยแพร่ทางอินเทอร์เน็ตนอกเหนือจากผลงานที่มีการตีพิมพ์ลงในวารสาร หรือ อื่นๆ วัดความสามารถในการเป็น "มหาวิทยาลัยอิเล็กทรอนิกส์ (E-university)" เกณฑ์การจัดอันดับของ Webometrics ประกอบด้วย
1. PRESENCE (20%) = จำนวนหน้าเว็บของมหาวิทยาลัยภายใต้โดเมน Contents published, every webpage, all formats, both static and dynamic pages (วัดด้วย Google)
2. OPENNESS (15%) =จำนวนไฟล์เอกสาร (.pdf, .doc, .docx, .ppt) ที่นำเสนอบนเว็บไซต์มหาวิทยาลัย และอ้างอิงได้จาก Google Scholar institutional research repositories, rich files published .pdf, .doc, .docx, .ppt (วัดด้วย Google Scholar)
3. IMPACT (50%) = จำนวนลิงค์ภายนอกที่ลิงค์มาเว็บไซต์มหาวิทยาลัย all external inlinks receives from third parties (วัดด้วย Majestic SEO and ahrefs)
4. EXCELLENCE (15%) = จำนวนบทความวิชาการตีพิมพ์ในวารสารนานาชาติ academic papers published in high impact international journals.
มหาวิทยาลัยมหิดล มีนโยบายในการพัฒนาเว็บไซต์โดยสนับสนุนให้ส่วนงานต่างๆ ได้มีการพัฒนาปรับปรุงทั้งรูปแบบและเนื้อหาไปในทิศทางเดียวกันอย่างต่อเนื่อง เพื่อให้เป็นช่องทางในการนำเสนอข่าวสารการประชาสัมพันธ์ การเผยแพร่ความรู้ ผลงาน และกิจกรรมทางวิชาการของมหาวิทยาลัย เผยแพร่ชื่อเสียง เกียรติภูมิ ภาพลักษณ์ของมหาวิทยาลัย ออกสู่สาธารณชนโลก และสร้างความเป็นที่รู้จัก (Visibility) ผ่านเครือข่ายอินเทอร์เน็ตอย่างเป็นระบบ ทั้งนี้เพื่อมุ่งสู่การเป็นหนึ่งในร้อยมหาวิทยาลัยชั้นนำระดับโลกตามเกณฑ์การจัดอันดับของ World University Rankings รวมทั้งการเป็น e-university ชั้นนำ ตามเกณฑ์การจัดอันดับมหาวิทยาลัยโลกด้วยระบบ Webometrics Ranking of World Universities จากผลการจัดอันดับครั้งล่าสุดนี้ ถือเป็นความสำเร็จของมหาวิทยาลัยมหิดล ที่ได้รับความร่วมมือจากคณะและหน่วยงานต่างๆภายในมหาวิทยาลัยที่ให้ความสำคัญในการพัฒนาเว็บไซต์ด้วยดีเสมอมา